سازمان‌های مردم نهاد (سمن) فعال حوزه میراث فرهنگی کشور با ارسال نامه‌ای خطاب به نجفی ریاست سازمان میراث فرهنگی کشور، در رابطه با رویه اخیر خروج آثار تاریخی کشور ابراز نگرانی و خواستار رسیدگی با متخلفان شدند.
متن نامه چنین است:
جناب آقای دکتر نجفی،
معاون محترم رئیس جمهور و ریاست سازمان میراث فرهنگی، صنایع دستی و گردشگری کشور؛
با درود و احترام،
همان‌گونه که استحضار داريد سازمان میراث فرهنگی، صنايع دستی و گردشگری یکی از ارکان مهم و متولی اصلی حفظ و احیاء هویت ایران اسلامی می‌باشد که به صراحت به این موضوع در اساسنامه سازمان نيز اشاره شده است و یکی از مهم‌ترین وظایف آن سازمان «ثبت آثار ارزشمند منقول و غیرمنقول فرهنگی- تاریخی کشور در فهرست آثار ملی و فهرست‌های ذیربط» عنوان گردیده است. تاکنون بیش از 30 هزار اثر در این فهرست ثبت و 16 اثر نیز در فهرست جهانی قرار گرفته است. متاسفانه از ابتدای دولت نهم، شاهد ثبت حساب نشده و همراه با پرونده‌های ناقص در مورد آثار و بناهای تاریخی کشور بوده‌ایم که این اتفاق به هیچ وجه به صلاح هویت کشور نبود و آرام آرام به یک معضل برای کشور و سازمان میراث فرهنگی تبدیل شد و بحرانی با نام "خروج آثار تاریخی از فهرست میراث ملی کشور" را به دنبال داشت.
روند فعلی خروج آثار تاریخی کشور از ثبت و تخریب‌های ناشی از آن، نگران‌کننده و نشان‌دهنده تخلف‌ها و کوتاهی بخش‌های مرتبط در این موضوع همچون اداره کل‌حقوقی سازمان میراث فرهنگی کشور و گاهی در استان‌ها و دفتر ثبت آثار کشور در سال‌های گذشته است. در اثر عدم رعایت موازین حقوقی در ثبت بناهای تاريخی و جبران نشدن حق "عدم النفع" مالکان از ثبت آثار تاریخی، به تدريج مالکان از سازمان میراث فرهنگی در دیوان عدالت اداری طرح شکایت کردند و از اواخر سال 1389 اولین اثر تاریخی کشور از ثبت خارج و تخریب شد و تاکنون بر اساس اطلاعات موجود، ده‌ها اثر تاریخی در کشور از ثبت خارج شده است. این موضوع از تهران آغاز و امروز در بيشتر نقاط کشور از جمله استان‌هايی چون اصفهان، خوزستان، فارس، همدان، یزد و غيره همه‌گیر شده است. اين موضوع تا آن‌جا پيش رفته که حریم کاخ گلستان به عنوان اولین اثر ثبت جهانی پایتخت و شانزدهمین اثر ثبت جهانی ایران، با رأی اخیر دیوان عدالت اداری شکسته شده و این اثر جهانی را در معرض خطر قرار گرفتن در فهرست میراث در خطر جهانی و حتی خروج از لیست آثار جهانی یونسکو قرار داده است.
اکنون با توجه به نگاه مثبت شما به موضوع ثبت آثار تاریخی و شأن ثبت در فهرست میراث ملی کشور به عنوان بخشی از هویت میلیون‌ها ایرانی و ديگر جهانيان، ما سازمان‌های غيردولتی فعال در زمينه ميراث فرهنگی کشور درخواست رسیدگی و شفاف‌سازی و ارايه گزارش آن به افکار عمومی، برخورد با متخلفان احتمالی و رفع ريشه‌های این بحران و بازگرداندن جایگاه ثبت آثار تاریخی در افکار عمومی از شما می‌باشیم. همچنين سازمان‌های غيردولتی و فعالان حوزه میراث فرهنگی از هر گونه کمک و همراهی برای حل اين معضل دریغ نخواهند کرد.
لازم به ذکر است گزارش کاملی از رویه خروج از ثبت آثار تاریخی در سال‌های اخیر و مستندات آن، از طرف شورای هماهنگی سازمان‌های غيردولتی ميراث فرهنگی، صنايع دستی و گردشگری ايران در روزهای آينده جهت استحضار و هرگونه اقدام لازم به حضورتان ارسال خواهد شد.
سازمان‌های مردم نهاد (سمن) امضا کننده به ترتيب نام:
1- انجمن آفتاب سرخ ( استان خوزستان )
2- انجمن آیاپیر ( استان خوزستان و تهران )
3- انجمن اسفندگان ( استان تهران )
4- انجمن ايرانشناسی کهن‌دژ ( استان همدان )
5- انجمن ایلام‌شناسی ایران ( استان تهران )
6- انجمن بوم آب و آفتاب ( استان خوزستان )
7- انجمن پویشگران سفر پاک ( استان همدان )
8- انجمن پیشگامان خورشید استهبان ( استان فارس )
9- انجمن جوانان سپید پارس ( استان مازندران )
10- انجمن چارسوق کویر اردکان ( استان یزد )
11- انجمن خانه فرآوران ایران ( استان تهران )
12- انجمن دوستان زمین ( استان همدان )
13- انجمن دوستداران آثار تاریخی و مفاخر نوش آباد ( استان اصفهان )
14- انجمن دوستداران حافظ – دفتر مشهد ( خراسان رضوی )
15- انجمن دوستداران ميراث فرهنگی افراز ( استان تهران )
16- انجمن دوستداران میراث فرهنگی ایذه - تاریشا ( استان خوزستان )
17- انجمن دوستداران ميراث فرهنگی تاریانا ( استان خوزستان )
18- انجمن دوستداران ميراث فرهنگی خرمشهر و آبادان - اوپاتان ( استان خوزستان )
19- انجمن دوستداران میراث فرهنگی گیلان ( استان گیلان )
20- انجمن دوستداران ميراث فرهنگی مازندران ( استان مازندران )
21- انجمن دوستداران میراث فرهنگی و بافت تاریخی یزد ( استان يزد )
22- انجمن دوستداران ميراث فرهنگی، صنايع دستی و گردشگری تاشار رامهرمز ( استان خوزستان )
23- انجمن دوستداران ميراث هوتو ( استان مازندران )
24- انجمن دوستداران و حافظان خشت‌خام ( استان يزد )
25- انجمن دوستداران یادمان‌ها ( استان قزوین )
26- انجمن ديدبانان ميراث ايل سنگسر ( استان سمنان )
27- انجمن فرهنگی اجتماعی اندیشه جوان ( استان اصفهان )
28- انجمن ميراث فرهنگی درودگاه ( استان فارس )
29- انجمن ميراث هزار ( استان کرمان )
30- خانه عصر باستان ( استان فارس )
31- خانه فرهنگ جاودان ( استان فارس )
32- کانون بارگاه مهر ( استان اصفهان )
33- کانون پاسارگاد ( استان گلستان )
34- کانون تهران‌شناسی ( استان تهران )
35- کانون مطالعات معماری قوام الدين شيرازی ( استان فارس )
36- کمیته پیگیری خانه‌های تاریخی ( استان تهران )
37- کميسيون انجمن‌های دوستدار ميراث فرهنگی و طبيعی مازندران ( استان مازندران )
38- موسسه ايرانشناسی نيستان گمشده ( خراسان رضوی )
39- موسسه تمدن نوين ( استان گلستان )
40- موسسه سرزمين باستان آرتا ( استان مرکزی )
41- موسسه سيراف پارس ( استان بوشهر )
42- موسسه گردشگران سبز اندیش ( استان گيلان )
43- هیات موسس بنیاد نوروز ( استان تهران )